计算机辅助教学平台
靶点结构的药物设计软件 型号:DS Flexible
药效团的药物设计软件 型号:DS Catalyst Comformation
分子力学与分子动力学计算软件 型号:DS CHARMM
小分子的药物设计软件 型号:DS QSAR Bundle
分析工具软件 型号:DS Biopolymer
蛋白质结构模拟软件 型号:DS ZDOCK
生产厂家:北京创腾科技有限公司
存放地:药学院一号楼324/327室
仪器功能:
• 生物大分子:蛋白/核酸的序列分析、蛋白进化分析、蛋白质三维结构的预测与模拟、蛋白质结构表面电荷分析及pKa值预测、膜蛋白的结构预测与模拟、抗体的设计与分析、蛋白理性设计、虚拟氨基酸突变、二硫键预测、丙氨酸扫描、饱和突变、蛋白聚集效应预测、核酸的设计与模拟、蛋白(核酸)-蛋白(核酸)相互作用、X-ray晶体结构解析等;
• 计算化学:分子力学计算和分子动力学模拟、量子力学/分子力学(QM/MM)计算等;
• 基于靶标结构药物设计:配体-靶标相互作用(分子对接)、全新药物设计、me too/me better药物设计、分子对接、基于结构的虚拟筛选、基于片段的药物设计等;
• 基于配体药物设计部分:完全基于配体的药效团设计、基于配体-受体复合物的药效团设计、化合物数据库的构建和筛选、药效团数据库的构建与保存、基于药效团数据库的反向找靶、定量构效关系(QSAR/QSPR)、构效关系分析(MMP)、虚拟组合化学库的设计与分析、类药性筛选、化合物构象搜索和分析、化合物ADMET性质预测等;
基于上述模拟功能,Discovery Studio的应用涵盖药物、化学、生物三大学科,研究领域包括:疾病的发病机理研究、新药发现和设计、生物信息学、结构生物学、酶学、免疫学、病毒学、蛋白质工程、肿瘤研究等。
